Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms