Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VEGFDO43915 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms