Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDELR3O43731 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms