Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms