Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DCLK1O15075 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLK1O15075 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCLK1O15075 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCLK1O15075 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCLK1O15075 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK1O15075 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK1O15075 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK1O15075 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK1O15075 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK1O15075 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK1O15075 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK1O15075 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK1O15075 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK1O15075 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK1O15075 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK1O15075 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLK1O15075 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms