Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOCS6O14544 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms