Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
BHLHE40O14503 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms