Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2LH3BP13 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms