Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1E9PL57 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms