Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms