Protein–RNA interactions for Protein: B7U540

KCNJ18, Inward rectifier potassium channel 18, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ18B7U540 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNJ18B7U540 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms