Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVV-1B6SEH8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms