Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4E171 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4E171 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4E171 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4E171 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4E171 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4E171 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4E171 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4E171 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4E171 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4E171 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4E171 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4E171 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4E171 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4E171 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4E171 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4E171 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
B4E171 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
B4E171 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4E171 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4E171 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4E171 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4E171 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4E171 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4E171 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4E171 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4E171 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4E171 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4E171 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4E171 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4E171 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4E171 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4E171 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
B4E171 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
B4E171 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4E171 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4E171 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4E171 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
B4E171 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4E171 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4E171 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4E171 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4E171 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4E171 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4E171 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
B4E171 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
B4E171 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4E171 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4E171 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4E171 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4E171 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4E171 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4E171 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4E171 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
B4E171 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4E171 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4E171 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4E171 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4E171 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4E171 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4E171 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4E171 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4E171 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4E171 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4E171 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4E171 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
B4E171 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4E171 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4E171 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
B4E171 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
B4E171 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
B4E171 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
B4E171 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
B4E171 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4E171 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4E171 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4E171 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
B4E171 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4E171 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
B4E171 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
B4E171 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4E171 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
B4E171 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4E171 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4E171 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4E171 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4E171 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4E171 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4E171 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4E171 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
B4E171 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4E171 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4E171 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4E171 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4E171 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4E171 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4E171 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4E171 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4E171 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4E171 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms