Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DXG7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DXG7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DXG7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DXG7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DXG7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DXG7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DXG7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DXG7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DXG7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DXG7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DXG7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DXG7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DXG7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DXG7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DXG7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DXG7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DXG7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DXG7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DXG7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DXG7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DXG7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DXG7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DXG7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DXG7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DXG7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DXG7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DXG7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DXG7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DXG7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DXG7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DXG7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DXG7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DXG7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DXG7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
B4DXG7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
B4DXG7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
B4DXG7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DXG7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DXG7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DXG7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DXG7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DXG7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DXG7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DXG7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DXG7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DXG7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DXG7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DXG7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DXG7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DXG7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
B4DXG7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
B4DXG7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
B4DXG7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
B4DXG7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
B4DXG7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
B4DXG7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
B4DXG7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
B4DXG7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
B4DXG7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
B4DXG7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DXG7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DXG7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DXG7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DXG7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DXG7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DXG7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DXG7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DXG7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DXG7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DXG7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DXG7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DXG7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DXG7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DXG7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DXG7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DXG7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DXG7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DXG7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DXG7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DXG7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DXG7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DXG7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DXG7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DXG7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DXG7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DXG7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DXG7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DXG7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DXG7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DXG7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DXG7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DXG7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DXG7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DXG7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DXG7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DXG7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DXG7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DXG7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DXG7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms