Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms