Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEURL1BA8MQ27 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEURL1BA8MQ27 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEURL1BA8MQ27 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms