Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYSRT1A8MQ03 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms