Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEFA5A3E0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEFA5A3E0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms