Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMB4A4D0S4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms