Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VWA8A3KMH1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms