Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBA6A0AVT1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms