Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SH3BP1Q9Y3L3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SH3BP1Q9Y3L3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SH3BP1Q9Y3L3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SH3BP1Q9Y3L3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SH3BP1Q9Y3L3 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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SH3BP1Q9Y3L3 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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