Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms