Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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