Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms