Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC32-202ENST00000402414 735 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC110015.1-201ENST00000423367 440 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNMB2-AS1-204ENST00000437488 964 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB6A-209ENST00000541973 1104 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAZAP2-208ENST00000549555 872 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 C14orf2-208ENST00000554713 1058 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 C14orf2-210ENST00000555030 749 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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KRTAP9-3Q9BYQ3 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF506-202ENST00000450683 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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