Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms