Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3R4Q99570 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3R4Q99570 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3R4Q99570 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3R4Q99570 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3R4Q99570 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3R4Q99570 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3R4Q99570 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3R4Q99570 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3R4Q99570 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3R4Q99570 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3R4Q99570 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3R4Q99570 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3R4Q99570 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3R4Q99570 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms