Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms