Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms