Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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ATG4DQ86TL0 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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ATG4DQ86TL0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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ATG4DQ86TL0 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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ATG4DQ86TL0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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