Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms