Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CXCL17Q6UXB2 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CXCL17Q6UXB2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CXCL17Q6UXB2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms