Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms