Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms