Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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