Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ZNF239Q16600 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ZNF239Q16600 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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