Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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GRIK4Q16099 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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GRIK4Q16099 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms