Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIP10Q15642 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms