Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms