Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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COL4A6Q14031 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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COL4A6Q14031 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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