Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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