Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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