Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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