Protein–RNA interactions for Protein: Q12934

BFSP1, Filensin, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP1Q12934 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BFSP1Q12934 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BFSP1Q12934 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms