Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FOXO1Q12778 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FOXO1Q12778 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FOXO1Q12778 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FOXO1Q12778 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FOXO1Q12778 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FOXO1Q12778 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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