Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CDY6P-201ENST00000413320 1266 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SNX18P8-201ENST00000455120 874 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 RBM48P1-201ENST00000509661 1102 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 OR9G3P-201ENST00000525553 918 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LDHC-208ENST00000544105 875 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LDHC-210ENST00000546146 701 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ACTG1P22-202ENST00000605503 859 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 RUNX2-AS1-201ENST00000563807 1513 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 EFCAB10-205ENST00000486180 1550 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC073072.1-201ENST00000325042 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 DECR1-201ENST00000220764 1207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 LINC00619-201ENST00000374432 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 RPL12P2-201ENST00000424565 493 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 FAM104B-203ENST00000425133 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms