Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLTCQ00610 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLTCQ00610 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms