Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms