Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA1P56159 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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